肖恩·奥斯汀出生在加利福尼亚的圣莫尼卡，父亲约翰·奥斯汀（John Astin）和母亲帕蒂·杜克（Patty Duke）都是著名演员，耳濡目染的肖恩小小年纪就对表演产生兴趣，1981年9岁的他与母亲一起出演了电视剧集《Please Don''t Hit Me, Mom》，4年后他在大银幕亮相，出演了《七宝奇谋》 （The Goonies）并获得一系列好角色的邀约。